郑玄投马融门下后，三年不为马融所看重，甚至一直没能见到他的面，只能听其高足弟子们的讲授。

　　尽管郑玄胸中所藏学识已经远远超过了马融的“高足”。但郑玄谨记先圣的话“三人行，必有吾师”。

　　他仍旧专心听讲，日夜寻究诵习，毫无怠倦。

　　有一次，马融和他的一些高足弟子在一起演算浑天问题，遇到了疑难而不能自解。

　　有人说郑玄精于数学，于是就把他召去相见。郑玄当场很快就圆满地解决了问题，使马融与在场的弟子们都惊服不已。

　　当时马融最器重品德高尚的卢植，他感慨的对卢植说:“吾等皆不如也。”

　　自此以后，马融对郑玄十分看重，郑玄便把平时学习中发现而未解决的疑难问题一一向马融求教，对于篇籍的奥旨寻微探幽，无不精研，终得百尺竿头再进一步。

　　郑玄在马融门下学习七年，因父母老迈需要归养，就向马融告辞回山东故里。马融此时已经感到郑玄是个了不起的人才，甚至会超过自己，他深有感慨地对弟子们说：“郑生今去，吾道东矣！”

　　从马融那里归来，郑玄已经四十多岁了。但他已经对百家之学无所不通，天下闻名。

　　许多人千里迢迢的来投到他的门下，拜他为师，听他讲学。

　　当时他家里还很贫穷，便“客耕东莱”，一面种田维持生计，一面教授门徒。

　　建宁元年，刘宏登基，第二次党锢之祸随之到来。

　　朝廷下诏各州郡查究党人，凡“党人”及其门生、故吏、父子、兄弟现居官位者，一概免职禁锢。

　　郑玄曾为杜密故吏，又曾受杜密的赏识与提携，所以也被视为党人。

　　郑玄被禁锢后，绝了仕进之路，便杜门不出，隐修经业，集中全部精力来进行遍注群经的工作，教导弟子。

　　汉代经学有今古文之分。今古文经不仅经文有所不同，更重要的是其解说和观点差异甚大。

　　秦始皇焚书后，汉代有一些老儒生凭记忆背诵出来一些经文，用当时通行的文字隶书记录并整理出来，叫做“今文经”。

　　西汉成、哀之世，刘向、刘歆父子校理秘书，发现了一部用古籀文字书写的《春秋左氏传》，再加上由孔壁所得的《仪礼》、《古文尚书》，和当时尚未立于学官的《毛诗》，便成了古文经的主要经典。研习今文经的，叫今文学派，修读古文经的，叫古文学派。

　　随着时间的迁移，古今经文逐渐水火不相容之势，发展到相互指责、论辩，相攻如仇。

　　后来，古文经也被立于学官，取得了合法的地位，两派的斗争更加经常和激烈了。

　　到东汉时，今古文经并行，古文学派的影响迅速扩大。郑玄进入经学界，正是处于今古文学派激烈斗争的形势之下。

　　郑玄先后师从第五元先、马融都属于古经文派系

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